Shūsuke Kaneko wurde am 8. Juni 1955 in Tokio geboren. In seinen Teenagerjahren begann er, Amateurfilme zu drehen, studierte jedoch an der Tokyo Gakugei University Pädagogik. Nach seinem Abschluss fand er eine Anstellung beim großen japanischen Filmstudio Nikkatsu. Kaneko gab im Februar 1984 sein Regiedebüt bei Nikkatsu mit Wet and Swinging. Das Jahr 1988 markierte einen Wendepunkt in Kanekos Karriere als Regisseur. Kaneko konzentrierte sich ganz auf den Mainstream-Film. Mitte bis Ende der 1990er Jahre erhielt Kaneko breite Anerkennung für die Regie der Kaiju-Filme Gamera: Guardian of the Universe (1995), Gamera 2: Attack of Legion (1996) und Gamera 3: Revenge of Iris (1999). Im folgenden Jahrzehnt inszenierte er Godzilla, Mothra and King Ghidorah: Giant Monsters All-Out Attack (2001), der heute als einer der besten Godzilla-Filme aller Zeiten gilt.